与阑尾腺癌预后差相关的因素包括高分期、高级别以及非黏液型组织学亚型。黏液扩散超过右下腹的1/4是一个的预后变量，如果黏液为无细胞性，预后可改善。当存在腹膜假黏液瘤，腹部膨胀、体重减轻、高组织学级别及存在浸润性生长的形态学证据均是不良预后的影响因素。反之，完整切除肿瘤就可以使生存期延长。阑尾腺癌转移至卵巢少见，并易与原发性卵巢肿瘤相混淆。局限性病变患者的5年生存率为86%,而区域性为74%,出现远处转移则为18%。
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