不公正的房产分割协议也是有效的。协议有效不等于就发生了物权变动的效力，对于不动产签订了分割协议，还要依法进行登记。看一个合同是否生效主要看以下要件：
第一、双方主体适格。精神、智力健全的完全民事行为能力人或者有营业执照的法人。
第二、意思表示真实。不存在欺诈、胁迫、乘人之危或者显失公平。
第三、内容不违背法律的强制性规定。第四、附条件、附期限的合同条件成就或者期限届满。
根据我国《民法典》的规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
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