法律分析：一、营业执照注销烟草证未注销是否会被处罚？
营业执照注销烟草证也要注销。公民、法人或者其他组织依法取得的烟草专卖许可证受法律保护。烟草专卖许可证所依据的法律、法规、规章修改、废止，或者办理烟草专卖许可证所依据的客观情况发生重大变化的，为了公共利益的需要，烟草专卖局可以依法变更或者撤回已经生效的烟草专卖许可证。
二、申请营业执照注销流程
申请营业执照注销流程为：
1．成立清算小组，对公司内部资产进行清算；
2．制作清算报告；
3．刊登注销公告；
4．注销税务、工商代码等。
《公司法》第七条规定，公司营业执照应当载明公司的名称、住所、注册资本、经营范围、法定代表人姓名等事项。公司营业执照记载的事项发生变更的，公司应当依法办理变更登记，由公司登记机关换发营业执照。
第一百八十规定，公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
法律依据：《中华人民共和国烟草专卖法》第十二条开办烟草制品生产企业，必须经烟草专卖行政主管部门批准，取得烟草专卖生产企业许可证，并经工商行政管理部门核准登记；其分立、合并、撤销，必须经烟草专卖行政主管部门批准，并向工商行政管理部门办理变更、注销登记手续。未取得烟草专卖生产企业许可证的，工商行政管理部门不得核准登记。
