1、被害人陈述。被害人所作的陈述，是证明强奸行为存在的直接证据。立案的条件需要有犯罪事实，被害人的陈述是证明犯罪事实存在的证据。
2、犯罪嫌疑人供述、辩解。立案的条件需要有犯罪嫌疑人，犯罪嫌疑人为直接主体，其证据较为直观。
3、发现场遗留的物证：如或可证明有性行为发生的场物品类证据，如遗留有嫌疑人、受害人精斑、血迹、毛发或者体液混合物的避孕套、床单、被套、枕巾、枕套、纸巾等物品，这类物证一般需要结合鉴定结论予以印证。
4、受害人可能遭受暴力的物品类证据，如被撕扯破的衣物、衣扣等;遗留的刀具、棍棒等凶器等。
5、受害人可能遭受性侵害且遗留有加害人体液的内裤、衣服、卫生巾等物品。
6、现场遗留的饮料、水杯、针管、针剂或者酒瓶、酒杯中等其他物证。如在麻醉类强奸案件中，存在加害人在饮料中添加、麻醉剂的现象，此类物证也需要结合鉴定结论等其他证据予以印证。
强奸罪取证一般是最先从考虑从阴道内获得嫌疑人的体液(精液)，受害人身上提取嫌疑人留下的线索，包括毛发、皮屑、体液(含汗水、口水、血液)、纤维等，环境许可还可考虑指纹、掌纹、脚印等许多线索，当然有视讯影音证据，那就最好了。采集证据需要根据情况来决定，总之线索可能很多，但办案的人是否有这个耐心，是否愿意作为，就很难说了。此外，被侵犯者，一定要在被侵犯后，第一时间报警并去医院或者法医保全证据，提取身上可能存留的嫌疑人线索。残留在体内的精液在经过一定时间后，就无法再被检出。
强奸和自愿性行为最大的区别是强奸是强迫发生的，所以除了上述物证外，还需要证明受害人是被强迫的，因此一般需要检视是否遭受暴力、恐吓、拘禁等行为。大多数强奸案件中，受害人曾被暴力虐待，因此会留下伤痕。至于恐吓和拘禁，要取证就很难了。大多数强奸案最后证据不足就在此处，无法证明是被强迫的，基于无罪推定的法理精神，只能认定无罪。因此，在遇到强奸行为时，无论对方用何种手段，都至少要反抗一下，留下点伤痕什么的，才好定案，不然只能徒呼奈何。
法律依据
《中华人民共和国刑法》
第二百三十六条 【强奸罪】以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。
奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。
强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：
（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；
（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；
（三）在公共场所当众强奸妇女、奸淫幼女的；
（四）二人以上轮奸的；
（五）奸淫不满十周岁的幼女或者造成幼女伤害的；
（六）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。
