退回补充侦查后撤案是合法的，一般情况下退回补充侦查意味着犯罪事实不能认定，需要由机关继续对相关情况进行补充侦查后，根据补充侦查的情况来作出处理，如果证据不足的，可以撤案。
对于退回补充侦查的案件，经县级以上机关负责人批准，机关可以根据不同情况分别作出处理。
1、对于证据不足的，机关应当在补充证据后，制作补充侦查报告书，移送审查起诉；对无法补充的证据，应当作出说明。补充侦查后即使证据依然不够充分，机关也不能自行处理，只能移送审查决定起诉或者不起诉。
2、在补充侦查过程中，机关发现新的同案犯或者新的罪行，需要追究刑事责任的，应当重新制作起诉意见书，移送审查。这时，侦查羁押期限和审查起诉期限存在重新计算的问题，但机关不能撤销原案件。
3、发现原认定的犯罪事实有重大变化，不应当追究刑事责任的，如发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者犯罪嫌疑人有刑诉法第15条六种不追究刑事责任的法定情形的，机关应当重新提出处理意见，并将处理结果通知退查的。按照刑诉法第161条的规定：“在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件。”只有在这种情况下，机关才能作出撤销案件决定。对于机关撤销案件的决定，检察机关应当加强监督，防止机关以罚代刑或者对证据不足案件作出撤销案件决定。
一、在什么情况下需要补充侦查？
人民认为犯罪事实不清、证据不足或者遗漏罪行、遗漏同案犯罪嫌疑人等情形，认为需要补充侦查的，应当提出具体的书面意见，连同案卷材料一并退回机关补充侦查；人民也可以自行侦查，必要时可以要求机关提供协助。
人民审查起诉部门对本院侦查部门移送审查起诉的案件审查后，认为犯罪事实不清、证据不足或者遗漏罪行、遗漏同案犯罪嫌疑人等情形，认为需要补充侦查的，应当向侦查部门提出补充侦查的书面意见，连同案卷材料一并退回侦查部门补充侦查。
二、补充侦查的期限
1、审查起诉阶段的补充侦查
人民审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在1个月以内补充侦查完毕。补充侦查以2次为限。补充侦查完毕移送人民后，人民重新计算审查起诉期限。对于补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。
2、法庭审理阶段的补充侦查
在法庭审理过程中，检察人员发现提起公诉的案件需要补充侦查，并提出补充侦查建议的，人民可以延期审理，补充侦查应当在1个月以内完毕。
